Фильм начинается с флешбэка прошлой части когда школьники и студенты отдыхают на озере Виктория, и становятся жертвами пираний. Проходит год, пляж и озеро давно закрыты и заброшены. Тем временем два фермера Клэйтон и Мо обнаруживают в озере мертвою корову, которая пускает газы. Клэйтон подносит зажигалку к заду коровы и корова взрывается. Оттуда вылетает стая пираний, которая набрасывается на Клэйтона и Мо, они оба погибают. На этот раз доисторические твари не ограничиваются лишь поедание туристов на озере Виктория. Действие фильма разворачивается в аквапарке Большой и мокрый, который является очень популярным среди молодежи благодаря эротическим нововведениям. Обнаженные девушки, алкоголь и веселье.

Тем временем, подруга главной героини — Эшли вместе с молодым парнем Трэвисом решают занятся любовью в фургоне. Девушка приковывает молодого человека наручниками к ножке стула. А фургон, по печальной случайности, слетает прямо в озеро. Эшли удается выбраться через окно, она взбирается на верхушку фургона и зовет на помощь. Но Трэвиса уже заживо сьедают допотопные пираньи. Через несколько минут девушка сама становится жертвой кровожадных рыбок, ее криков никто не слышит.

На следующее утро полиция вытаскивает утонувший фургон из воды, но внутри никого нет. Шелби, лучшая подружка Эшли, безумно расстраивается по этому поводу и идет к озеру. Вместе с Мэдди они беседуют по душам и внезапно на них нападают пираньи, девушкам удается выкарабкаться. Уже на береге они убивают одну из тварей и забирают труп с собой. Ребята приходят к ихтиологу Карлу Гудману (персонаж первой части), изучающему этот вид пираний, он рассказывает им об их обнаружении и опасности попаданий этих животных через трубы в аквапарк. Молодые люди вынуждены иследовать озеро. На них нападают пираньи, но все-таки ребятам удается выплыть живыми.

И вот наступает торжественное открытие аквапарка. Один из посетителей — шериф Фэллон, в прошлом году спасший не одну жизнь у озера Виктория, но впоследствии потеряв ноги. Вместе с Дрю Каннингеном (оператор Деррека из прошлой части, упавший в воду, но тем не менее не ставшей жертвой пираний) он пытается преодолеть боязнь воды. Отчим Мэдди выкачивает воду из подземных озер, таким образом давая прекрасную возможность пираниям начать свой кровавый террор. Чэд категорически отказывается закрывать аквапарк и эвакуировать людей и успокаивает Мэдди. Темнокожий шериф пытается помочь спасти людей от атаки зубастых тварей. Друг Мэдди, Бэрри, отключает нассосы бассейна, Мэдди не может выбраться из воды и просит у Кайла помощи, но тот убегает. Бэрри выносит Мэдди из воды и они целуются. Тем временем Кайл всё таки осмеливается прыгнуть в воду и спасти Мэдди. Он находит какой то плавающий обглоданный пираньями труп, но потом замечает что Бэрри уже спас Мэдди. В этот момент насосы аквапарка взрываются. От взрыва погибают пираньи и Кайл. Кайл находился рядом и на него упал острый жезл, тем самым проткнув ему голову насквозь.

После этого Мэдди звонит мистер Гудман и говорит что пираньи эволюционируют. Теперь они могут ходить (при этом нам показывают, что пиранья, хранившаяся у Гудмана ещё с первой части, сбежала). Мэдди говорит что она уже в курсе так как видит как выжившая пиранья вылазит из воды. К этой пиранье подбегает мальчик и начинает снимать на камеру. Пиранья прыгает и откусывает ему голову. Его тело лежит и хлещет кровью. На этом фильм кончается.