Тарам-пара-рам!
Сегодняшним солнечным утром моя мысль наконец оформилась.
Итак, господа и дамы, не кажется ли вам Шисуи темной лошадкой? Друг Итачи, источник Шарингана Данзо и довольно сильный шиноби. Не связан ли он с этой странной историей?
1. Итачи вступает в АНБУ, где знакомится с милым пожилым дядей Данзо. У Итачи уже тогда были причуды вида "в этом клане нет свободы", в этом он был полностью согласен со своим приятелем Шисуи. Получив шаринган оба молодых человека проникают в комнату собраний клана и читают записи на стене.
1.1. А у дяди Данзо свои отдельные планы. Некоторое время назад создается база для Акацки.
2. Вместе с Данзо они что-то задумывают. Создается коалиция. Рождается план "Убежать От Судьбы"(название не имееит значения).
3. Инсценировав смерть Шисуи(потом объясню варианты получения МШ Итачи), коалиция начинает активные действия. Кстати, Шисуи с этого момента действует под именем Тоби.
4. Вырезка клана осуществляется членами коалиции совместно с подчиненными Данзо. Саске они оставляют в живых как резервный запас шарингана.
5. После вырезки клана Итачи и Тоби(Шисуи) попадают в Акацки.
6. Происходит известная нам история. А потом внутри коалиции начинаются разногласия.
7. Таким образом Данзо оказывается напротив Тоби в 474 главе.

Сейчас начну написание разъяснений по каждому пункту если не передумаю.

Итак, о шаринганах. Если даже заменить в моей версии Шисуи на Мадару или на того, кто Мадарой притворяется, то с шариками все в общих чертах сходится.
Допустим, Обито и Шисуи - родные братья. Чакра у них схожа.
Итачи убивает Шисуи, тело забирают АНБУшники Корня. Достают глазки. Один глаз идет к Данзо, другой к третьему союзнику(Тоби).
И - тарам-пара-рам - все похожести сходятся.

Да, ляпов много. Пока это бред. Но перспективы большие.