После того как тела убил, Джи закончил гензу (или Конан его вывела), он их подозвал только после этого.

гендзютсу Джирайи обездвиживает тело, т.е. сковывает нервы

Полная парализация нервной системы как с иллюзией жаб.

Это не генза будет, потому что не будет иллюзий.

Он его не заканчивал. Он разве сказал "кай"? Нет. А если бы Конан могла, то сделала бы это намного раньше, а не ждала бы пока тела сольют. Так что пока не докажешь обратное, придется тебе придерживаться следующей мысли:

гендзютсу Джирайи обездвиживает тело, т.е. сковывает нервы

А куб? Или это суровая реальность?

При этом он мог общаться в иллюзии с Джи, так как он контролировал тела.

Это тоже гендзюцу. Просто она s уровня. Парализация нервной системы через звуковые волны.

По этой причине Пейн с ним общался в иллюзи, но телами шевелить не мог.

Только попав в иллюзию можно в ней общаться. Иначе никак, поэтому разум был в иллюзии. Да и сам Пейн сказал, что вы поймали меня.

Цукиёми тоже как-то не очень на иллюзию смахивает. Потусил в мире грёз 3 дня и всё...не можешь встать. Так же как техника оцепенения.

В случае если Нагато переносит свой разум

Если же нет, то он просто обездвижил тела гензой, влияя на нервные окончания.

При этом он мог общаться в иллюзии с Джи, так как он контролировал тела. Проще говоря Джи обездвижил тела, но не парализовал разум.

Он прекратил технику и Нагато вышел из гензы (Джи то думал, что убил) и зачем говорить "кай"?

Генза Джи сковывает нервы и сознание.

И с кем он там разговаривал? Просто с телом без разума?

NeXuS_[Sk32], если разум Нагато не попал в гензу, он в иллюзии ни с кем бы не говорил и вообще не было бы никакой иллюзии.

И вообще, гензюцу - это техники иллюзий, так что сознание обязательно должно попасть, иначе не будет иллюзий.

Он (Нагато) телом управляет как? За веревочки? Или он разумом двигает суставы? Правилен второй вариант, а значит в гендзютсу он попадет. Но так как в телах он не всем своим сознанием находится, а лишь управляет, то тела попадут под категорию "сковываются нервы", а разум (частичный) будет при теле присутствовать.

Четыре громадные жабы и куб с жидким наполнителем из ниоткуда. Чем не иллюзия?

Нагато и попал в гензу, он звуки слышит, слышал и жабью песню.

Иллюзия, а это и означает, что разум Нагато попал в гензу.

Тогда как ты объяснишь то, что уже через секунду после формального убийства Джирайей трех тел, за спиной саннина появилось четвертое? Нагато тела не телепортирует, а значит оно двигалось пока остальные были в гендзютсу.

Частичный разум, иначе бы он до сих пор был в гендзютсу, т.к. Джи его НЕ отменял, ссылаясь на то что жертвы мертвы.

Частичный разум - это глупо. Разум один у Нагато.

Тела были призваны до этого, это даже говорится в манге.

Зачем Джи дальше продолжать гензу (тратить чакру), если он считал, что убил их и тем более он стал уходить?

Генджутсу заканчивается когда жабы протыкают соперника. Это значит что джирая закончил генджутсу.